La actividad de investigación, innovación y transferencia de la Universitat Oberta de Catalunya se organiza en más de treinta grupos de investigación, vinculados a un estudio o área, o a uno de los dos centros de investigación de la Universidad. Catorce de esos grupos han sido reconocidos por la Generalitat de Cataluña en la última convocatoria de 2009.
La investigación, básicamente realizada por el profesorado, en la actualidad se especializa en los ámbitos de las artes y humanidades, las ciencias sociales, las ciencias de la salud y la tecnología y la comunicación: identidad, cultura, arte y sociedad; tecnología y acción social; globalización, pluralismo jurídico y derechos humanos; fiscalidad, relaciones laborales y prestaciones sociales; internet, tecnologías digitales y nuevos medios; sistemas y servicios de la información y las comunicaciones, y gestión de la información y las comunicaciones. Hay que destacar dos áreas especialmente significativas con respecto a la actividad científica de la UOC: la sociedad de la información y el conocimiento y el aprendizaje virtual (e-learning). Toda esta actividad se vehicula a través de dos centros de investigación: el Internet Interdisciplinary Institute (IN3) y el eLearn Center (eLC).
El IN3, como instituto de investigación de la UOC, focaliza su actividad en el ámbito interdisciplinario de la sociedad de la información y el conocimiento y da apoyo a un total de diez grupos de investigación y seis programas de investigación.
El eLC es un centro de investigación, innovación y formación en aprendizaje virtual dedicado esencialmente a la educación superior y a la formación a lo largo de la vida. Aparte de las personas que son miembros a título individual, un total de diez grupos de investigación y de innovación, integrados por profesorado y personal de gestión, desarrollan su actividad en él. En la actualidad, tiene unos ciento quince miembros.