Au sein de l'organisation interne de l'Université Ouverte de Catalogne, le Conseil d'administration est l'organe collégial supérieur de gouvernance. Sa fonction est d'orienter, de planifier et d'évaluer l'activité universitaire ainsi que d'établir les lignes d'action générales de l'université dans tous les domaines qui la concernent.
La rectrice est la première autorité de l'Université et la responsabilité maximale lui incombe en matière de représentation, de gouvernance et d'administration de l'Université. La rectrice est assistée par les vice-recteurs et par le secrétaire général, qui se charge de la direction de la gestion ordinaire de l'université et de la nomination des directeurs d'études et des directeurs de domaines.