1. La RAE considera que ch, ll y rr son dígrafos. Así pues, las palabras que las contengan deben alfabetizarse considerando que son combinaciones de letras, no letras.
2. Las palabras con guion o apóstrofo se clasifican como si no lo tuvieran. En el caso de palabras que solo se distinguen porque una tiene guion y la otra no, esta va en primer lugar.
3. Las palabras que llevan tilde o diéresis suelen clasificarse como si no la llevasen. En el caso de palabras que solo se distinguen por la tilde o la diéresis (sea porque una lleva alguno de estos signos y la otra no, sea porque los llevan diferentes), el orden de clasificación es el siguiente:

1.º: sin tilde
2.º: con tilde
3.º: con diéresis

Por tanto:  

4. Las mayúsculas y minúsculas se igualan. En el caso de que dos palabras coincidan en sus caracteres excepto en el hecho de tener una la primera letra minúscula y la otra mayúscula, esta se suele ordenar después de aquella. Por tanto:
   
   
   anfitrión
   Anfitrión

5. En el caso de dos o más palabras que se diferencian solo por la posición relativa de una misma diferencia, se aplican los criterios establecidos teniendo en cuenta solo la primera posición diferencial a partir del principio de la palabra. Por tanto:
   
   
   calculó
   cálculo

6. Además, en el caso de la bibliografía, al ordenar alfabéticamente el nombre de los autores, no se tienen en cuenta las preposiciones —ni españolas ni extranjeras—, como de, von, van, etc., que se ponen detrás del apellido, a continuación del nombre o de su inicial.
   
   
   Mozos, S. de los [y no De los Mozos, S.]
   Riemsdijk, H. van [y no Van Riemsdijk, H.]
   Saussure, F. de [y no De Saussure, F.]
7. En el caso de la bibliografía, al ordenar alfabéticamente el nombre de los autores, si el elemento que encabeza el apellido es un artículo o los tratamientos san y santa, este elemento mantendrá su posición como si se tratara de un apellido independiente.
   
   
   La Mota, Aurora
   Las Heras, Antonio
   Lo Savio, Francesco
   San José, María
   Santa Ana, Ignacio
8. En el caso de ordenación alfabética de términos complejos, es decir, de más de una palabra, se aplica la ordenación discontinua. Este tipo de clasificación tiene en cuenta, en primer lugar, el primer componente del sintagma, después la palabra plena (sustantivo, adjetivo...) o el nexo que aparece en segundo lugar (preposición, conjunción, artículo...); y así sucesivamente. Por ejemplo:
   
   

   punta punta afilada punta corriente punta de cigarrillo punta de diamante punta de espárrago punta de lanza punta de París punta de velocidad punta seca puntada puntal puntapié puntaumbreño

   San Lorenzo de El Escorial San Luis Potosí San Miguel del Padrón Sanlúcar de Barrameda Sant Adrià de Besòs Sant Agustí de Lluçanès Sant Amanç de Pedrós Sant Andreu de Castellbò Santa Agnès del Munt Santa Maria de Merlès Santander Santanyí Santes Creus Santo Domingo

   
   

   Este tipo de ordenación ofrece una gran ventaja desde el punto de vista terminológico, ya que, como tiene en cuenta los espacios en blanco y los caracteres no alfabéticos (guiones, apóstrofos, acentos, etc.) que se encuentran en los componentes de un sintagma, permite agrupar los términos que pertenecen a una misma serie léxica sin las interrupciones que provocaría una ordenación continua como la que se muestra a continuación:

   punta punta afilada punta corriente puntada punta de cigarrillo punta de diamante punta de espárrago punta de lanza punta de París punta de velocidad puntal puntapié punta seca puntaumbreño

   San Lorenzo de El Escorial Sanlúcar de Barrameda San Luis Potosí San Miguel del Padrón Santa Agnès del Munt Sant Adrià de Besòs Sant Agustí de Lluçanès Sant Amanç de Pedrós Santa Maria de Merlès Santander Sant Andreu de Castellbò Santanyí Santes Creus Santo Domingo